Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fgfr1P16092 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fgfr1P16092 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgfr1P16092 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgfr1P16092 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms