Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkceP16054 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkceP16054 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkceP16054 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkceP16054 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkceP16054 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkceP16054 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkceP16054 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkceP16054 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkceP16054 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms