Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp53P15975 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp53P15975 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp53P15975 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp53P15975 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp53P15975 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp53P15975 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp53P15975 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp53P15975 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp53P15975 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp53P15975 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp53P15975 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp53P15975 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp53P15975 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms