Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd44P15379 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd44P15379 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd44P15379 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd44P15379 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd44P15379 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd44P15379 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd44P15379 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms