Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
Dnmt1P13864 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Dnmt1P13864 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Dnmt1P13864 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms