Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnni2P13412 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnni2P13412 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnni2P13412 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms