Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DmdP11531 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DmdP11531 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DmdP11531 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DmdP11531 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DmdP11531 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DmdP11531 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DmdP11531 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DmdP11531 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DmdP11531 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DmdP11531 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DmdP11531 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DmdP11531 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DmdP11531 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DmdP11531 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DmdP11531 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DmdP11531 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DmdP11531 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DmdP11531 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DmdP11531 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DmdP11531 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DmdP11531 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DmdP11531 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DmdP11531 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DmdP11531 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DmdP11531 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DmdP11531 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DmdP11531 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DmdP11531 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DmdP11531 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DmdP11531 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DmdP11531 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DmdP11531 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DmdP11531 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DmdP11531 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DmdP11531 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DmdP11531 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DmdP11531 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DmdP11531 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DmdP11531 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DmdP11531 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DmdP11531 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DmdP11531 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DmdP11531 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DmdP11531 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DmdP11531 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DmdP11531 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DmdP11531 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DmdP11531 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DmdP11531 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DmdP11531 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DmdP11531 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DmdP11531 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DmdP11531 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DmdP11531 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DmdP11531 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DmdP11531 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DmdP11531 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DmdP11531 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DmdP11531 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DmdP11531 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DmdP11531 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DmdP11531 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DmdP11531 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DmdP11531 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DmdP11531 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DmdP11531 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DmdP11531 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DmdP11531 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DmdP11531 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DmdP11531 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DmdP11531 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DmdP11531 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DmdP11531 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DmdP11531 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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