Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc6P10629 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc6P10629 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms