Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Schip1P0DPB4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms