Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6c1P0CW02 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms