Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pla2g4bP0C871 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pla2g4bP0C871 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pla2g4bP0C871 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms