Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb2P0C1T1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms