Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spta1P08032 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spta1P08032 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spta1P08032 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spta1P08032 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Spta1P08032 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Spta1P08032 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spta1P08032 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spta1P08032 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spta1P08032 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spta1P08032 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spta1P08032 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spta1P08032 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spta1P08032 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms