Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna4P07351 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms