Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna5P07349 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms