Protein–RNA interactions for Protein: P06876

Myb, Transcriptional activator Myb, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MybP06876 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MybP06876 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MybP06876 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MybP06876 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MybP06876 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MybP06876 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MybP06876 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MybP06876 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MybP06876 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MybP06876 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MybP06876 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MybP06876 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MybP06876 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MybP06876 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MybP06876 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MybP06876 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MybP06876 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MybP06876 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MybP06876 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MybP06876 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MybP06876 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MybP06876 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MybP06876 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MybP06876 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MybP06876 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MybP06876 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MybP06876 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MybP06876 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MybP06876 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MybP06876 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MybP06876 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MybP06876 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MybP06876 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MybP06876 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MybP06876 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MybP06876 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MybP06876 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MybP06876 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MybP06876 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MybP06876 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MybP06876 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MybP06876 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MybP06876 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MybP06876 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MybP06876 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MybP06876 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MybP06876 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MybP06876 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MybP06876 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MybP06876 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MybP06876 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MybP06876 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MybP06876 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MybP06876 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MybP06876 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MybP06876 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MybP06876 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MybP06876 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MybP06876 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MybP06876 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MybP06876 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MybP06876 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MybP06876 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MybP06876 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MybP06876 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MybP06876 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MybP06876 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MybP06876 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MybP06876 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MybP06876 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MybP06876 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MybP06876 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MybP06876 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MybP06876 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms