Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06344 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06344 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06344 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06344 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06344 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06344 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06344 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06344 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06344 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06344 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06344 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06344 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06344 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P06344 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06344 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P06344 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06344 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06344 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06344 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06344 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06344 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P06344 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P06344 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P06344 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06344 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06344 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06344 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06344 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06344 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06344 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P06344 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06344 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06344 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06344 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06344 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06344 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06344 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06344 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06344 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06344 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06344 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06344 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06344 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06344 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06344 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06344 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06344 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P06344 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06344 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06344 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06344 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06344 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06344 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06344 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06344 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06344 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06344 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06344 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P06344 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P06344 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06344 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06344 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P06344 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06344 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06344 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P06344 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P06344 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P06344 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms