Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Got1P05201 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Got1P05201 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Got1P05201 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Got1P05201 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Got1P05201 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Got1P05201 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Got1P05201 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Got1P05201 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Got1P05201 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Got1P05201 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Got1P05201 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Got1P05201 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Got1P05201 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Got1P05201 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Got1P05201 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Got1P05201 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Got1P05201 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Got1P05201 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Got1P05201 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Got1P05201 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Got1P05201 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Got1P05201 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Got1P05201 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Got1P05201 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Got1P05201 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Got1P05201 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Got1P05201 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Got1P05201 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Got1P05201 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Got1P05201 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Got1P05201 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Got1P05201 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Got1P05201 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Got1P05201 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Got1P05201 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Got1P05201 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Got1P05201 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Got1P05201 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Got1P05201 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Got1P05201 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Got1P05201 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Got1P05201 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Got1P05201 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Got1P05201 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Got1P05201 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Got1P05201 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Got1P05201 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Got1P05201 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Got1P05201 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Got1P05201 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Got1P05201 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Got1P05201 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Got1P05201 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Got1P05201 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Got1P05201 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Got1P05201 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Got1P05201 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Got1P05201 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Got1P05201 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Got1P05201 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Got1P05201 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Got1P05201 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Got1P05201 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Got1P05201 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Got1P05201 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Got1P05201 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Got1P05201 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Got1P05201 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Got1P05201 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Got1P05201 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Got1P05201 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Got1P05201 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Got1P05201 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Got1P05201 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Got1P05201 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Got1P05201 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Got1P05201 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Got1P05201 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Got1P05201 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Got1P05201 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Got1P05201 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Got1P05201 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Got1P05201 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Got1P05201 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Got1P05201 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Got1P05201 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Got1P05201 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Got1P05201 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Got1P05201 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms