Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd3dP04235 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms