Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P04214 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04214 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P04214 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P04214 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04214 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04214 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04214 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04214 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04214 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04214 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04214 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04214 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04214 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04214 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04214 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04214 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04214 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04214 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04214 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04214 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04214 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04214 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04214 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04214 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04214 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04214 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P04214 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P04214 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P04214 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P04214 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P04214 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P04214 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P04214 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P04214 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P04214 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P04214 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
P04214 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P04214 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
P04214 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P04214 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P04214 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P04214 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P04214 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P04214 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P04214 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P04214 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P04214 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P04214 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P04214 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P04214 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P04214 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P04214 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P04214 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P04214 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P04214 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P04214 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P04214 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P04214 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P04214 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P04214 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P04214 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P04214 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P04214 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04214 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04214 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04214 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
P04214 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04214 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04214 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04214 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04214 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04214 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04214 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P04214 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P04214 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P04214 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P04214 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms