Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01853 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01853 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01853 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01853 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01853 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01853 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01853 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01853 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01853 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01853 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01853 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01853 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01853 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01853 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01853 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01853 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01853 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01853 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01853 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01853 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01853 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01853 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01853 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms