Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01811 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01811 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01811 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01811 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01811 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01811 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01811 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01811 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01811 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01811 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01811 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01811 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01811 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01811 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01811 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01811 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01811 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01811 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01811 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01811 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01811 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01811 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01811 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01811 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01811 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01811 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01811 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01811 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01811 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01811 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01811 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01811 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01811 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01811 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01811 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01811 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01811 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01811 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01811 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01811 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01811 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01811 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01811 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01811 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01811 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01811 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01811 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01811 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01811 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01811 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01811 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01811 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01811 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01811 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms