Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01800 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01800 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01800 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01800 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01800 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01800 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01800 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01800 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01800 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01800 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01800 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01800 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01800 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01800 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01800 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01800 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01800 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01800 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01800 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01800 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01800 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01800 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01800 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01800 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01800 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01800 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01800 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01800 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01800 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01800 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01800 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01800 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01800 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01800 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01800 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01800 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01800 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01800 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01800 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01800 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01800 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01800 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01800 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01800 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01800 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01800 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01800 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01800 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01800 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01800 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01800 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01800 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01800 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01800 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01800 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01800 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01800 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01800 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01800 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01800 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01800 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01800 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01800 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01800 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms