Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01786 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01786 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01786 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01786 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01786 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01786 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01786 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01786 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01786 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01786 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01786 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01786 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01786 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01786 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01786 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01786 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01786 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01786 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01786 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01786 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01786 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01786 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01786 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01786 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01786 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01786 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01786 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01786 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01786 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01786 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01786 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms