Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01747 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01747 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01747 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01747 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01747 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01747 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01747 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01747 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01747 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01747 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01747 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01747 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms