Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01734 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01734 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01734 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01734 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01734 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01734 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01734 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01734 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01734 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01734 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01734 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01734 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01734 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
P01734 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01734 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01734 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
P01734 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01734 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01734 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01734 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01734 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01734 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01734 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01734 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01734 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01734 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
P01734 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01734 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01734 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01734 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01734 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01734 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01734 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01734 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01734 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01734 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01734 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01734 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
P01734 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01734 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01734 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01734 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01734 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01734 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01734 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01734 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01734 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01734 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
P01734 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01734 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01734 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01734 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01734 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01734 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01734 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01734 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
P01734 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01734 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01734 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01734 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01734 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01734 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01734 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01734 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01734 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
P01734 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01734 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01734 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01734 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01734 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01734 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01734 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01734 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01734 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01734 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01734 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms