Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01659 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01659 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01659 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01659 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01659 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01659 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01659 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01659 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01659 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01659 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01659 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01659 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01659 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01659 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01659 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01659 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01659 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01659 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01659 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01659 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01659 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01659 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01659 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01659 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01659 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01659 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01659 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms