Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01648 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01648 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01648 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01648 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
P01648 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01648 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01648 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01648 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01648 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
P01648 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01648 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01648 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01648 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
P01648 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
P01648 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01648 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01648 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01648 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01648 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01648 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01648 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01648 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01648 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01648 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01648 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01648 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01648 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01648 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01648 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01648 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01648 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01648 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01648 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01648 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01648 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01648 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01648 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01648 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01648 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01648 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01648 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01648 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01648 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
P01648 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01648 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01648 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01648 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01648 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01648 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01648 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01648 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01648 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01648 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01648 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
P01648 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01648 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01648 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01648 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01648 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01648 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01648 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01648 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01648 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01648 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01648 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
P01648 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01648 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01648 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01648 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01648 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01648 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01648 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01648 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01648 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01648 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01648 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01648 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01648 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01648 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01648 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01648 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01648 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01648 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01648 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
P01648 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01648 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01648 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01648 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01648 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms