Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Igk-V19-17P01633 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Igk-V19-17P01633 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Igk-V19-17P01633 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Igk-V19-17P01633 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Igk-V19-17P01633 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Igk-V19-17P01633 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Igk-V19-17P01633 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Igk-V19-17P01633 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Igk-V19-17P01633 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms