Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna1P01572 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms