Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4bP01029 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4bP01029 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4bP01029 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4bP01029 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4bP01029 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4bP01029 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C4bP01029 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C4bP01029 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C4bP01029 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C4bP01029 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C4bP01029 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C4bP01029 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C4bP01029 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C4bP01029 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4bP01029 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
C4bP01029 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4bP01029 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4bP01029 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4bP01029 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4bP01029 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4bP01029 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4bP01029 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C4bP01029 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
C4bP01029 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C4bP01029 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C4bP01029 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C4bP01029 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C4bP01029 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C4bP01029 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C4bP01029 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C4bP01029 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4bP01029 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C4bP01029 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C4bP01029 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C4bP01029 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C4bP01029 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C4bP01029 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C4bP01029 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C4bP01029 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C4bP01029 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C4bP01029 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C4bP01029 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C4bP01029 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C4bP01029 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C4bP01029 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4bP01029 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4bP01029 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4bP01029 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
C4bP01029 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4bP01029 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
C4bP01029 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4bP01029 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4bP01029 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4bP01029 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4bP01029 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
C4bP01029 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4bP01029 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4bP01029 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4bP01029 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4bP01029 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4bP01029 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4bP01029 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4bP01029 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4bP01029 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4bP01029 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4bP01029 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C4bP01029 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C4bP01029 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4bP01029 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C4bP01029 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4bP01029 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4bP01029 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4bP01029 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4bP01029 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4bP01029 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4bP01029 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4bP01029 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4bP01029 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C4bP01029 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4bP01029 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4bP01029 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4bP01029 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4bP01029 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4bP01029 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4bP01029 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4bP01029 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4bP01029 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4bP01029 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4bP01029 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms