Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abl1P00520 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abl1P00520 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abl1P00520 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abl1P00520 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abl1P00520 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abl1P00520 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abl1P00520 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Abl1P00520 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abl1P00520 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Abl1P00520 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abl1P00520 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abl1P00520 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms