Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopeO89079 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopeO89079 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopeO89079 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopeO89079 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CopeO89079 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CopeO89079 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CopeO89079 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CopeO89079 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CopeO89079 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CopeO89079 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CopeO89079 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CopeO89079 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CopeO89079 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CopeO89079 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopeO89079 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopeO89079 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopeO89079 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopeO89079 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopeO89079 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopeO89079 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopeO89079 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopeO89079 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopeO89079 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopeO89079 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopeO89079 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopeO89079 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopeO89079 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopeO89079 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopeO89079 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopeO89079 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CopeO89079 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CopeO89079 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CopeO89079 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CopeO89079 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopeO89079 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CopeO89079 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CopeO89079 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CopeO89079 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CopeO89079 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CopeO89079 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CopeO89079 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CopeO89079 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopeO89079 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopeO89079 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopeO89079 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopeO89079 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopeO89079 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopeO89079 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopeO89079 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopeO89079 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms