Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc6O89033 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc6O89033 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms