Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CpdO89001 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CpdO89001 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CpdO89001 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CpdO89001 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CpdO89001 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CpdO89001 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CpdO89001 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CpdO89001 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CpdO89001 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CpdO89001 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CpdO89001 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CpdO89001 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CpdO89001 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CpdO89001 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CpdO89001 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CpdO89001 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CpdO89001 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CpdO89001 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CpdO89001 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CpdO89001 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CpdO89001 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CpdO89001 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CpdO89001 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CpdO89001 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CpdO89001 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CpdO89001 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CpdO89001 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CpdO89001 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CpdO89001 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CpdO89001 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CpdO89001 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CpdO89001 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CpdO89001 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CpdO89001 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CpdO89001 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CpdO89001 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CpdO89001 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CpdO89001 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CpdO89001 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CpdO89001 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CpdO89001 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CpdO89001 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CpdO89001 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CpdO89001 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CpdO89001 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CpdO89001 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CpdO89001 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CpdO89001 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CpdO89001 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CpdO89001 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CpdO89001 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CpdO89001 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CpdO89001 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CpdO89001 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CpdO89001 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CpdO89001 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CpdO89001 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CpdO89001 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CpdO89001 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CpdO89001 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CpdO89001 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CpdO89001 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CpdO89001 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CpdO89001 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CpdO89001 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CpdO89001 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CpdO89001 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CpdO89001 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CpdO89001 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CpdO89001 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CpdO89001 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CpdO89001 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CpdO89001 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CpdO89001 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CpdO89001 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CpdO89001 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CpdO89001 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CpdO89001 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CpdO89001 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CpdO89001 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CpdO89001 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CpdO89001 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CpdO89001 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CpdO89001 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CpdO89001 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CpdO89001 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms