Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a20bO88575 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a20bO88575 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms