Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nme6O88425 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme6O88425 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme6O88425 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme6O88425 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme6O88425 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms