Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AvilO88398 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AvilO88398 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AvilO88398 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AvilO88398 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AvilO88398 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AvilO88398 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AvilO88398 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AvilO88398 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AvilO88398 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AvilO88398 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AvilO88398 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AvilO88398 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AvilO88398 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AvilO88398 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AvilO88398 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AvilO88398 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AvilO88398 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AvilO88398 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AvilO88398 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AvilO88398 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AvilO88398 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AvilO88398 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AvilO88398 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AvilO88398 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AvilO88398 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AvilO88398 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AvilO88398 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AvilO88398 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AvilO88398 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AvilO88398 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AvilO88398 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AvilO88398 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AvilO88398 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AvilO88398 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AvilO88398 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AvilO88398 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AvilO88398 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AvilO88398 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AvilO88398 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
AvilO88398 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AvilO88398 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
AvilO88398 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AvilO88398 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AvilO88398 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AvilO88398 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AvilO88398 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AvilO88398 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AvilO88398 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AvilO88398 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
AvilO88398 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AvilO88398 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AvilO88398 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AvilO88398 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AvilO88398 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AvilO88398 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AvilO88398 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AvilO88398 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AvilO88398 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
AvilO88398 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AvilO88398 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms