Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vti1bO88384 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vti1bO88384 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms