Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt1O88346 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms