Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc4a4O88343 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms