Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hmx1O70218 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms