Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkbO55229 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkbO55229 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkbO55229 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkbO55229 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChkbO55229 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms