Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChadO55226 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChadO55226 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChadO55226 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChadO55226 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChadO55226 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChadO55226 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChadO55226 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChadO55226 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChadO55226 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChadO55226 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChadO55226 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChadO55226 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChadO55226 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChadO55226 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChadO55226 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChadO55226 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChadO55226 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChadO55226 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChadO55226 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChadO55226 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChadO55226 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChadO55226 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ChadO55226 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChadO55226 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChadO55226 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChadO55226 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChadO55226 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChadO55226 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChadO55226 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChadO55226 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChadO55226 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChadO55226 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ChadO55226 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ChadO55226 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChadO55226 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChadO55226 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChadO55226 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChadO55226 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChadO55226 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChadO55226 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChadO55226 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChadO55226 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChadO55226 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChadO55226 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChadO55226 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChadO55226 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ChadO55226 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChadO55226 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChadO55226 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ChadO55226 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ChadO55226 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChadO55226 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChadO55226 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ChadO55226 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ChadO55226 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChadO55226 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ChadO55226 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChadO55226 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChadO55226 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChadO55226 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChadO55226 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChadO55226 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChadO55226 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChadO55226 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChadO55226 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChadO55226 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ChadO55226 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChadO55226 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChadO55226 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChadO55226 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChadO55226 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChadO55226 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChadO55226 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChadO55226 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChadO55226 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChadO55226 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChadO55226 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChadO55226 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChadO55226 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChadO55226 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChadO55226 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChadO55226 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChadO55226 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChadO55226 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChadO55226 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChadO55226 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ChadO55226 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChadO55226 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ChadO55226 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms