Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms