Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cyp26a1O55127 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cyp26a1O55127 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26a1O55127 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms