Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp10O55123 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp10O55123 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp10O55123 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp10O55123 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mmp10O55123 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms