Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrxO55103 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrxO55103 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PrxO55103 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrxO55103 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PrxO55103 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PrxO55103 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PrxO55103 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PrxO55103 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PrxO55103 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PrxO55103 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrxO55103 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrxO55103 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrxO55103 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrxO55103 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrxO55103 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrxO55103 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrxO55103 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrxO55103 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrxO55103 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PrxO55103 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PrxO55103 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PrxO55103 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PrxO55103 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PrxO55103 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrxO55103 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrxO55103 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrxO55103 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrxO55103 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrxO55103 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrxO55103 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrxO55103 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PrxO55103 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrxO55103 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrxO55103 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PrxO55103 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PrxO55103 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PrxO55103 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PrxO55103 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PrxO55103 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PrxO55103 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PrxO55103 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PrxO55103 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PrxO55103 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PrxO55103 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PrxO55103 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PrxO55103 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrxO55103 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrxO55103 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrxO55103 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrxO55103 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PrxO55103 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrxO55103 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrxO55103 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrxO55103 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PrxO55103 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrxO55103 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrxO55103 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrxO55103 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrxO55103 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrxO55103 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrxO55103 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrxO55103 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrxO55103 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrxO55103 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PrxO55103 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PrxO55103 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PrxO55103 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PrxO55103 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PrxO55103 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PrxO55103 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PrxO55103 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PrxO55103 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PrxO55103 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PrxO55103 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PrxO55103 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PrxO55103 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PrxO55103 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PrxO55103 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PrxO55103 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PrxO55103 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PrxO55103 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PrxO55103 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PrxO55103 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PrxO55103 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PrxO55103 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PrxO55103 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PrxO55103 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PrxO55103 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PrxO55103 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PrxO55103 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PrxO55103 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PrxO55103 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PrxO55103 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PrxO55103 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PrxO55103 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PrxO55103 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PrxO55103 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PrxO55103 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PrxO55103 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms