Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms