Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom1O54990 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom1O54990 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prom1O54990 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prom1O54990 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prom1O54990 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prom1O54990 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prom1O54990 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms